1，甲醇：以甲醇为碳源，反硝化反应为 6NO3-+ 5CH3OH → 3N2+ 5CO2 + 7H2O + 6OH- ，根据此反应去除1mg NO3-N 需要1.9mg CH3OH。以甲醇作为碳源比以葡萄糖作为碳源反硝化速率快很多。甲醇在保存和使用上都需要多注意，甲醇对人体有低毒，因为甲醇在人体新陈代谢中会氧化成比甲醇毒性更强的甲醛和甲酸。
2，面粉：小麦面粉，成分上也是非常高的。当缺氧或者厌氧池子中的污泥浓度较低时，通过以小麦面粉补充碳源对活性污泥的形成是有着很大的帮助的。同时，面粉也较容易买到。如设备的容积比较小，可以考虑以面粉作为碳源。
3，葡萄糖：葡萄糖作为代表性的碳水化合物，作为外部碳源具有良好的治疗效果。但作为一种多分子化合物，容易引起大量细菌繁殖，导致污泥膨胀，增加出水COD值，影响出水水质 。同时，与甲醇碳源相比，碳水化合物更容易产生亚硝酸盐氮积累。
4，乙酸钠：乙酸钠（CH3COONa)作为碳源，是小分子有机酸的原因， 反硝化菌易于利用，脱氮效果是较好的。易溶于水，易被微生物所利用，所产生的污泥量相比于其他碳源时略高，价格上也是高于以面粉，葡萄糖，甲醇作为碳源的。
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